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TCGA&GEO高通量分析班

背景简介:

2019年度国家自然基金医学科学部共批资助10138项目,批助金额总计441310万元。其中面上项目数量占45%,金额占57%;青年科学基金项目数量占43%,金额占20%。

初步统计,这些项目中大部分都与编码基因有直接或间接的关联。其中,与通路(pathway)关联的有1349项,金额4.89亿;与miRNA相关的有630项,金额2.3亿;与lncRNA相关的有395项,金额1.45亿; 

如何获得有创新意义的疾病靶标基因(mRNA,Protein,lncRNA,circRNA,miRNA,Mutation等)是项目申请及文章写作时最常见的问题。基于这个目的,我们开展了该培训班:TCGA&GEO高通量数据挖掘。癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA数据库中包含了常见了40种癌症方向(含30000个样本)的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加!另外,其他疾病的研究可以通过GEO数据库进行。

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会议预期:

通过三天的学习,我们了解生信分析思路对项目及文章的帮助,以及实操常见的数据库、在线工具和本地软件。使得学员可以自己完成一个完整的分析报告并获得疾病相关的靶标基因。

讲师简介:宋伟博士

成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。

培训经历:在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场培训班。

主办方:上海遐永医药科技有限公司

会议时间:2020年10月16-18日(两天两晚)

16日夜间19:00-22:00;

17日白天8:30-18:00,夜间19:00-22:00;

18日白天8:30-17:00

会议地点:医药加ZOOM网络会议室

会务费用:3200元/人

优惠政策:

1.提前确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料

2.三人组团报名,每人优惠100元

3.四人组团报名,每人优惠200元,

4.六人组团报名缴费,可免1人参会费! 

可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。 

注意事项:必须使用win7以上系统的电脑,现场不得录音录像。上课软件为Cytoscape,Heml,GSEA,R和Rstudio。

另外需安装ZOOM会议软件。

交费方式:

A:银行转账

账户名称:上海遐永医药科技有限公司    账户号:31050161413600000900

开 户 行:中国建设银行上海川沙支行 

B:支付宝转账

收款人:yonghong1028@126.com     户  名:金永红

C:现场刷卡(仅部分支持)

报名方式:

王炳和 13818765978(微信同号)

邮箱:13818765978@163.com

发回报名邮件后若24h内未收到回复,请及时电话联系确认

详细日程参见日程表


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通过本次学习,您可以学会以下作图(包括但不限于)

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