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高通量数据挖掘与网络图分析班

生物信息学(bioinformatics)定义:是在大分子方面的概念型的生物学,并且使用了信息学的技术,这包括了从应用数学、计算机科学以及统计学等学科衍生而来各种方法,并以此在大尺度上来理解和组织与生物大分子相关的信息。

培训目的:

很多老师都做过测序或者芯片实验,虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析,比如过滤、质控、比对、定量和差异等,但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析,并不能完整的讲一个故事!因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力,从海量信息中获得自己想要的关键基因!

培训预期:通过2天的培训,使学员掌握生信文献分析思路和8个实用操作知识点(具体见最后),可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。

生物信息学魅力:

帮助预测疾病相关的潜在基因,以及该基因潜在的作用靶点、上游调控转录因子等,从而指导实验方向、缩小试验范围、简化试验流程。

为基金申请提供支持,通过强大的信息数据的收集整理,减少投入增强研究目的性;且通过整合技术优势,指导提高临床诊断水平。

丰富的免费的数据资源和生物软件工具: 数据库:NCBI, EBI, DDBJ, PDB, SWISS-PROT等;软件工具:Cytoscape,BLAST,  R语言,String,  David等

案例:

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该文献的分析流程如下图所示:

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我们可以看到该文献主要的分析步骤有:差异表达分析、聚类热图构建、GO和KEGG 通路分析、蛋白互作网络分析、生存曲线分析等。我们的主题基本上按照类似的文献思路进行讲解,和大家一起分享一下一篇SCI文章的生信分析步骤。

通过2~3天的学习,我们可以掌握一篇生信SCI文献的所有分析模块,并可以独立的结合自己的研究方向进行生信分析和数据挖掘,获得一套属于自己的分析结果。

讲师简介:

宋伟,交大生物信息学博士,参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。

培训经历:在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。

培训方向:《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等

培训时间:2019年8月3-4日,2日可报到(下午3点-晚上8点)

培训地点:长春市朝阳区新民大街1448号  海航长白山宾馆 

报到地点:海航长白山宾馆 (报到联系人:金老师 18917745941)

房间价格:普通350/间,豪华380/间,需通过主办方预定 

主办方:上海遐永医药科技有限公司

收费标准:会务费:2800元每位(包含电子版教材、午餐,住宿费自理。)

优惠政策:

1. 提前确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料

2. 三人组团报名,每人优惠100元

3. 四人组团报名,每人优惠200元,

4. 五人组团报名缴费,额外带一人免费注册! 

可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。 

注意事项:携带windows系统的电脑,苹果电脑请务必提前做好双系统。

交费方式:

A:银行转账

账户名称:上海遐永医药科技有限公司    账户号:31050161413600000900

开 户 行:中国建设银行上海川沙支行 

B:支付宝转账

收款人:yonghong1028@126.com     户  名:金永红

C:现场刷卡

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通过该主题的学习,可以学会:

1.高通量公共数据的详细信息查找/下载;

2.在线做差异表达分析

3.在线blast分析

4.基因ID转换

5.通路map图制作

6.功能富集分析

7.蛋白互作分析

8.网络图的构建和美化。

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报名方式

范红春 15301721511(微信同号)

邮箱:15301721511@163.com

发回报名邮件后若24h内未收到回复,请及时电话联系确认