1. 背景介绍
基因组DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰方式,是调控细胞分化发育过程中基因表达的主要机制之一,它并不改变基因序列,但是可以遗传给后代,容易受外界环境的影响而发生改变,在胚胎发育、干细胞分化、癌症发生等方面发挥着重要的作用。结合RNA-seq和甲基化测序可以进一步了解基因表达量与DNA甲基化之间的相关性,从转录调控着手深入分析疾病的发病机理。
2. 分析流程:
(1)甲基化位点的分布
(2)差异甲基化区域(DMR)的分布
(3) DMR分布circos图
(4)与DMR有交集的promoter下游基因的功能分析
(5)针对DMR区域的转录因子基序富集分析
(6)DNA甲基化谱-基因表达谱关联分析