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表观组测序/芯片

DNA甲基化测序


1.     背景介绍

    基因组DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰方式,是调控细胞分化发育过程中基因表达的主要机制之一,它并不改变基因序列,但是可以遗传给后代,容易受外界环境的影响而发生改变,在胚胎发育、干细胞分化、癌症发生等方面发挥着重要的作用。结合RNA-seq和甲基化测序可以进一步了解基因表达量与DNA甲基化之间的相关性,从转录调控着手深入分析疾病的发病机理。

2. 分析流程:

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3.   预期结果(部分结果展示)


1)甲基化位点的分布

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2)差异甲基化区域(DMR)的分布

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(3)    DMR分布circos


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4DMR有交集的promoter下游基因的功能分析


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5)针对DMR区域的转录因子基序富集分析


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6DNA甲基化谱-基因表达谱关联分析


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